云南有機肥的突出作用是改善土壤有機質。土壤中的有機質可以顯著改善土壤的理化特性，提高土壤耕作能力，提高滲水能力，提高土壤蓄水、肥料保護、肥料供應和抗旱防澇能力，這是化肥不可替代的。有機肥不僅能防止生態環境惡化，提高環境質量，而且在農業生產中發揮著巨大的作用。
  1.提高土壤肥力
  土壤中95%的微量元素以不溶形式存在，不能被植物吸收利用。微生物代謝物中含有大量的有機酸，就像冰中加入的熱水一樣，能迅速溶解鈣、鎂、硫、銅、鋅、鐵、硼、鉬等植物必需的礦物質元素，成為植物可以直接吸收利用的營養元素，大大提高了土壤的供肥能力。
  有機肥中的有機質增加了土壤中的有機質含量，降低了土壤粘結度，增強了砂土保水保肥性能，使土壤形成穩定的顆粒結構，發揮了良好的肥力協調供應能力。使用有機肥后，土壤會變得松散和肥沃。
  2.提高土壤質量，促進土壤微生物繁殖
  云南有機肥能使土壤中的微生物大量繁殖，特別是許多有益的微生物，如固氮菌、氨化菌、纖維素分解菌等。.這些有益微生物可以分解土壤中的有機物，增加土壤的顆粒結構，改善土壤組成。
  微生物在土壤中繁殖得很快，它們就像一個看不見的網，復雜而復雜。微生物菌體死亡后，土壤中留下了許多細管，不僅增加了土壤的透氣性，而且使土壤蓬松柔軟，營養水分不易流失，提高了土壤儲存能力，避免和消除了土壤的硬化。
  有機肥中的有益微生物也能抑制有害細菌的繁殖，從而減少用藥。如果連續使用多年，可以有效抑制土壤有害生物，節約勞動力，省錢，無污染。
  同時，有機肥料包括動物消化道分泌的各種活性酶和微生物產生的各種酶。這些物質在土壤中施用后，可以大大提高土壤的酶活性。長期使用有機肥可以提高土壤質量。從根本上提高土壤質量，不怕種植水果。
  3、提供農作物所需營養，保護農作物根莖
  有機肥料含有大量的營養物質、微量元素、糖和脂肪。
  分解釋放有機肥CO2可作為物光合作用的材料。有機肥還含有氮、磷、鉀三要素，有機質45%，能為作物提供營養。
  同時，必須提到有機肥在土壤中分解，可轉化形成各種腐殖酸是一種聚合物，具有良好的復合吸附性能，對重金屬離子具有良好的復合吸附效果，可有效減少重金屬離子對作物的毒性，防止其進入植物，保護腐殖酸物質的根。
  4.增強作物抗病、抗旱、抗澇能力
  云南有機肥含有維生素、抗生素等，可以增強作物的抗性，減少或預防疾病的發生。有機肥施入土壤后，可提高土壤的蓄水保水能力，提高干旱作物的抗旱能力。
  同時，有機肥還能疏松土壤，改善作物根系生態環境，促進根系生長，增強根系活力，提高作物耐澇性，降低植物死亡率，提高農產品生存率。
  提高食品安全性和綠色性
  我國已明確規定，農業生產過程必須限制無機肥料的過度使用，有機肥是綠色食品生產的主要肥源。由于有機肥中的各種營養元素相對完整，這些物質是完全無害、無污染的天然物質，為生產高產、無污染的綠色食品提供了必要的條件。上述腐殖酸物質重金屬離子對植物的危害，相當于減少重金屬對人體的危害。
  5.提高作物產量
  有機肥中的有益微生物利用土壤中的有機物產生二次代謝物，其中含有大量的促生長物質。例如，生長素可以促進植物的伸長和生長，脫落酸可以促進果實的成熟，赤霉素可以促進開花和坐果，增加開花數量和保果率，提高產量，使果實飽滿、鮮嫩，提前上市，增加產量和收入。
  6.減少營養流失，提高化肥利用率
  化肥的實際利用率只有30%~45%。損失的化肥部分解釋放入大氣中，部分隨水土流失，部分固定在土壤中，不能直接被植物吸收利用。
  施用有機肥后，由于有益生物活性，土壤結構得到改善，土壤保水保肥能力得到提高，養分流失得到減少。此外，有益微生物解磷解鉀，化肥的有效利用率可提高到50%以上。

  有機肥的優點表明它是不可替代的。與化肥相比，未來人們將相應選擇有機肥。有機肥的廣泛使用將有效降低農業生產成本和環境污染，滿足現代農業可持續發展的要求。